Los niveles organiozacionales son las categorías dentro de la estructura orgánica de la entidad que reflejan la dependencia jerárquica entre sus unidades de organización. Se clasifican en:

• Primer nivel: Órganos de Alta Dirección y según corresponda órganos resolutivos u órganos consultivos.
• Segundo nivel: Órganos de línea y órganos de administración interna.
• Tercer nivel: Unidades orgánicas.
• Cuarto nivel: Subunidades orgánicas, áreas, etc. (de carácter excepcional).

En base al dimensionamiento de las entidades, éstas excepcionalmente se pueden organizar jerárquicamente en un cuarto o mayor nivel organizacional, siempre que estén debidamente sustentados. Asimismo, los órganos desconcentrados configuran un nivel organizacional, salvaguardando su dependencia jerárquica.